フリースクールの費用に使える補助金・助成金は?相場と支援制度を解説

「フリースクールに通わせたいけど、費用がどれくらいかかるか不安…」
「月々の負担を少しでも軽くするために、利用できる補助金や支援制度があれば知りたい」

不登校の子どものための選択肢であるフリースクールですが、その利用を考えたときに多くの方が直面するのが費用の問題です。公的な学校ではないため、ある程度の経済的な負担は避けられません。

フリースクールの費用は月々いくらくらいかかるのでしょうか?そして、その負担を軽減するための補助金や助成金は存在するのでしょうか?

この記事では、フリースクールの費用相場から、国や自治体が設けている補助金・支援制度、そして費用を抑えるための実践的なポイントまで、お金に関する情報を分かりやすくまとめました。

経済的な不安を少しでも解消し、お子さんが安心して新しい学びの場に踏み出せるよう、詳しく解説していきます。

不登校生徒の保護者が選ぶ
総合満足度が高いフリースクール

総合満足度
4.7
マンツーマンで手厚く
高校進学率も◎

トライ式中等部
総合満足度
4.5
勉強/ゲーム/アニメ
が学べて通いやすい

バンタンゲームアカデミー中等部
総合満足度
4.4
ICT+プログラミング
オンライン授業に強い

第一学院中等部

*日本全国どこでもオンラインで学べて、出席認定も受けやすいスクールのみ掲載しています

「不登校になってもフリースクールという選択肢がある」と知っておくだけでも親の精神負担は軽くなります。いざ不登校になるとどうすればいいかわからなくなる方も多いので、情報収集だけは早めにしておきましょう。

目次

🔍 フリースクールの費用相場と詳しい内訳

まず、フリースクールの費用がどれくらいかかるのか、具体的な数字を見ていきましょう。

」一般的には月額3万円~5万円程度が相場と言われていますが、これはあくまで平均的な数字です。

フリースクールは運営母体(NPO法人、民間企業、教育機関など)や活動内容、サポート体制によって費用が大きく異なります。そのため、実際には月額1万円台から10万円以上まで、かなり幅があることを理解しておく必要があります。

費用の主な内訳

月々の費用の主な内訳は以下の通りです。入会時と毎月の費用をしっかり把握しておくことが大切です。

費用項目金額の目安備考
入学金5万円~10万円入会時のみ(施設によっては不要)
月額授業料(会費)3万円~5万円通学頻度により変動
施設維持費3,000円~5,000円/月光熱費・設備費など
教材費5,000円~1万円/年教科書・ワーク代など
イベント参加費実費校外学習・キャンプなど
交通費実費通学定期券など

週に何日通うかによって料金プランが異なる場合が多く、週5日通学の場合と週2~3日の場合では、月額費用が2倍以上違うこともあります。

また、学習指導やカウンセリング、プログラミングやアート活動などをオプションとして追加料金を設定している施設もあります。

【実例】タイプ別の費用シミュレーション

実際にフリースクールに通う場合、年間でどれくらいの費用がかかるのか、タイプ別にシミュレーションしてみましょう。

【ケース①】通学型フリースクール(週5日通学)
  • 入学金: 10万円(初年度のみ)
  • 月額授業料: 5万円 × 12ヶ月 = 60万円
  • 施設維持費: 5,000円 × 12ヶ月 = 6万円
  • 教材費: 1万円
  • 年間合計: 約77万円(初年度は87万円)
【ケース②】オンラインフリースクール
  • 入学金: 3万円(初年度のみ)
  • 月額授業料: 2万円 × 12ヶ月 = 24万円
  • 教材費: 5,000円
  • 年間合計: 約24.5万円(初年度は27.5万円)
【ケース③】週2~3日通学プラン
  • 入学金: 5万円(初年度のみ)
  • 月額授業料: 3万円 × 12ヶ月 = 36万円
  • 施設維持費: 3,000円 × 12ヶ月 = 3.6万円
  • 教材費: 8,000円
  • 年間合計: 約40.4万円(初年度は45.4万円)

入会前には必ず費用の総額と内訳を詳細に確認することが重要です。見学や体験の際に、料金表や追加費用の有無についてしっかり質問しましょう。

フリースクールの選び方については、費用だけでなく、出席扱い制度の有無や学習サポート体制、お子さんとの相性など、総合的に判断することが大切です。

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トライ式中等部

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通所頻度週1日〜週5日
通学スタイル通学型・在宅型・オンライン型
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トライ式中等部は、個別指導のトライグループが運営するフリースクールです。小学生から中学生まで幅広く受け入れており、一人ひとりの学習状況に合わせた完全マンツーマン指導が最大の特長です。

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バンタンゲームアカデミー中等部

施設数20箇所12都道府県
通所頻度週1日〜週5日
通学スタイル通学制/オンライン併用可(キャンパス・コースにより異なる)
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ゲーム・イラスト・eスポーツなど、クリエイティブ分野に特化した教育を行う「バンタンゲームアカデミー中等部」。中学生の段階から、制作や表現を中心とした学びに取り組めるスクール。少人数制のクラスで、無理なく通いやすい環境が整っています。

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第一学院中等部

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通所頻度オンライン+月1〜4回
通学スタイルオンライン・通学型
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第一学院中等部は、オンライン教育が充実しているフリースクールです。ICTを活用した個別サポートが充実しており、月1〜4回の通学指導で不登校生徒にも対応。在籍中学校との連携で、中学校の出席として認められることもおあります。

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💰 フリースクールの費用に利用できる補助金・助成金制度

フリースクールの費用負担を軽減するための、国や自治体による補助金・支援制度が存在します。これらの制度を知っているかどうかで、年間数十万円の差が生まれることもあります。ここでは代表的な制度を詳しく紹介します。

自治体独自の補助金・助成金制度

近年、不登校の子どもが増加している背景を受け、自治体が独自にフリースクール利用料の一部を補助する制度を設ける動きが全国的に広がっています。2026年1月時点で、全国の約30%の自治体が何らかの形でフリースクール支援制度を導入しています。

【東京都の事例】フリースクール等利用者支援事業

東京都では「フリースクール等利用者支援事業」として、都内在住の小中学生の保護者を対象に、月額最大2万円の助成を行っています。年間で最大24万円の支援が受けられるため、経済的な負担を大きく軽減できます。

対象となる条件は、都内在住の小中学生であること、認定されたフリースクール等に通っていること、世帯収入が一定基準以下であること、学校長の承認を得ていることなどです。

【大阪市の事例】不登校児童生徒支援事業

大阪市では、市内在住の不登校児童生徒がフリースクール等に通う場合、月額1万5千円を上限として利用料の一部を助成しています。年間最大18万円の支援が受けられます。

【神奈川県の事例】フリースクール等支援事業

神奈川県内の複数の市町村でも、独自の支援制度を設けています。横浜市では月額1万円、川崎市では月額1万5千円を上限とした助成制度があります。

⚠️ 重要なポイント
  • これらの制度は全ての自治体で実施されているわけではありません
  • 助成額や所得制限などの条件は自治体により大きく異なります
  • 申請期間が限定されている場合があります
  • 対象となるフリースクールが指定されている場合があります

まずはお住まいの市区町村のウェブサイトで「(自治体名) フリースクール 補助金」といったキーワードで検索するか、教育委員会の窓口に直接問い合わせてみましょう。不登校の親の会などで情報交換するのも有効な方法です。

国の就学支援金制度(高等学校等就学支援金)

これはフリースクール自体への補助ではありませんが、関連する重要な制度です。

「通信制高校サポート校」の役割を持つフリースクールに通い、同時に連携する通信制高校に在籍している場合、高校の授業料に対して国の「高等学校等就学支援金」が適用されます。

世帯収入に応じて授業料の一部または全額が支給されるため、実質的な負担を大きく減らすことができます。年収約590万円未満の世帯であれば、公立高校の授業料相当額(年額11万8,800円)が支給され、私立の通信制高校であれば、年収に応じて最大39万6,000円まで支給されます。

高校進学を見据えた学習を考えている場合、この制度を活用できるフリースクールを選ぶことで、経済的な負担を大幅に軽減できます。

その他の支援制度

就学援助制度

経済的な理由で就学が困難な家庭を対象とした「就学援助制度」があります。この制度は本来、在籍校に通う子どもを対象としていますが、自治体の判断によっては、フリースクールに通う場合でも給食費や学用品費などが援助の対象となるケースがあります。

これも自治体によって対応が大きく異なるため、在籍している学校や教育委員会への確認が必要です。

生活困窮者自立支援制度

生活に困窮している世帯を対象とした総合的な支援制度です。子どもの学習支援も含まれており、フリースクール費用の一部が支援対象となる場合があります。市区町村の福祉課や社会福祉協議会に相談してみましょう。

民間団体による奨学金・支援金

一部のNPO法人や民間団体が、不登校の子どものためのフリースクール利用を支援する奨学金制度を設けています。金額や条件は団体により異なりますが、月額数千円から数万円の支援が受けられる場合があります。

最初に検討したいフリースクールTOP3

総合満足度
4.7
マンツーマンで手厚く
高校進学率も◎

トライ式中等部
総合満足度
4.5
勉強/ゲーム/アニメ
が学べて通いやすい

バンタンゲームアカデミー中等部
総合満足度
4.4
ICT+プログラミング
オンライン授業に強い

第一学院中等部

*日本全国どこでもオンラインで学べて、出席認定も受けやすいスクールのみ掲載しています

📋 補助金を利用する際の注意点と申請方法

補助金や助成金は非常に助かる制度ですが、知っているだけでは支援を受けられません。いくつかの重要な注意点と、実際の申請手順について詳しく解説します。

申請が必要(自動適用されない)

これらの制度は、児童手当のように自動的に適用されるわけではありません。保護者の方が自治体の窓口へ期間内に申請手続きを行う必要があります。申請を忘れると、1年分の支援金を受け取れないこともあるため、注意が必要です。

必要な申請書類

一般的に、以下のような書類が必要となります。

申請に必要な書類(例)
  • 補助金・助成金申請書(自治体指定の様式)
  • フリースクールの在籍証明書
  • 利用料の領収書(月ごと、または年間分)
  • 世帯の収入証明書(源泉徴収票、確定申告書など)
  • 住民票の写し
  • 学校長の承認書(出席扱いを受けている場合)
  • 印鑑(認印)

自治体により必要書類は異なるため、事前に問い合わせて確認しましょう。

対象となる施設が指定されている場合がある

自治体によっては、補助金の対象となるフリースクールを「認証施設」として指定している場合があります。通いたいフリースクールが補助金の対象になっているかを、入会前に必ず確認することが大切です。

認証施設の条件として、一定の活動実績があること、適切な運営体制が整っていること、安全管理が徹底されていること、定期的な活動報告を行っていることなどが求められます。

フリースクールの見学に行く際は、「この施設は自治体の補助金対象になっていますか?」と直接質問するのが確実です。多くのフリースクールは、補助金制度について詳しく説明してくれます。

補助金申請の流れ

一般的な申請の流れは以下の通りです。

📝 補助金申請のステップ
  • 情報収集
    市区町村の公式サイトや教育委員会で制度の有無を確認
  • 対象施設の確認
    通いたいフリースクールが補助対象かを確認
  • 必要書類の準備
    在籍証明書や領収書などを揃える
  • 申請書の作成
    自治体指定の様式に必要事項を記入
  • 申請書類の提出
    教育委員会または指定窓口に提出(郵送可の場合も)
  • 審査
    自治体による書類審査(1~2ヶ月程度)
  • 交付決定通知
    補助金額の決定通知が届く
  • 補助金の受け取り
    指定口座に振り込み(後払い方式が一般的)

💡 費用を抑えるための5つの実践ポイント

補助金制度を活用する以外にも、工夫次第でフリースクールの費用負担を軽減する方法があります。ここでは、実際に多くの保護者が実践している5つのポイントを紹介します。

ポイント①:通学頻度を調整する

多くのフリースクールでは、週5日通学プラン、週3日プラン、週1~2日プランなど、通学頻度に応じた料金設定があります。最初から週5日で通う必要はありません。

まずは週2~3日から始めて、お子さんが慣れてきたら徐々に日数を増やすという方法も、経済的負担を抑えながら無理なく通える選択肢です。週2日プランなら月額2万円台から利用できるフリースクールもあります。

ポイント②:オンライン型とのハイブリッド利用

オンラインフリースクールと通学型フリースクールを組み合わせて利用する方法も効果的です。例えば、週に1~2日は通学型で対面での学習や交流を行い、残りの日はオンラインで学習を続けるというスタイルです。

オンライン型は月額1万円~3万円程度と通学型より割安なため、ハイブリッド利用することで費用を抑えながら、対面でのサポートも受けられるというメリットがあります。

ポイント③:兄弟割引・紹介割引を活用する

多くのフリースクールでは、兄弟姉妹で通う場合の兄弟割引や、既存会員からの紹介による紹介割引制度を設けています。入学金が半額になったり、月額料金が10~20%割引になるケースもあります。

見学や体験の際に、「兄弟割引や紹介割引はありますか?」と積極的に質問してみましょう。

ポイント④:NPO法人運営のフリースクールを検討する

NPO法人が運営するフリースクールは、利益を目的としていないため、民間企業運営のフリースクールと比べて費用が比較的安価に設定されている傾向があります。

月額2万円台から利用できる施設も多く、入学金が不要なところもあります。ただし、スタッフの人数や設備面では民間企業運営の施設に劣る場合もあるため、実際に見学して判断することが大切です。

ポイント⑤:出席扱い制度を活用する

出席扱い制度を活用することで、直接的に費用が減るわけではありませんが、内申点への影響を最小限に抑えられるため、結果的に将来の進学費用を抑えることにつながります。

公立高校への進学が可能になれば、私立高校に比べて年間数十万円の学費負担を減らせます。出席扱い制度が活用できるフリースクールを選ぶことは、長期的な教育費の観点からも重要です。

まとめ:まずはお住まいの自治体の制度を確認しよう

フリースクールの費用は、月額3万円~5万円程度が相場ですが、通学頻度や施設により大きく異なります。決して安いものではありませんが、その負担を軽減するための補助金や助成金制度は、特に自治体レベルで年々充実してきています。

フリースクールの利用を検討する際は、まずお住まいの市区町村に利用できる制度がないかを確認することから始めましょう。月額2万円の助成があれば、年間24万円もの支援が受けられます。

💡 今日からできる3つのアクション
  • 自治体の補助金制度を調べる
    市区町村の公式サイトまたは教育委員会に問い合わせ
  • 気になるフリースクールの資料請求
    費用や支援制度について詳しい情報を入手
  • 実際に見学・体験に参加
    費用対効果を実際に確認してから決断

経済的な不安を少しでも解消し、お子さんが安心して新たな一歩を踏み出せるよう、積極的に情報を集めて活用していくことが大切です。「お金がないからフリースクールは無理」と諦める前に、まずは制度を調べてみましょう

また、不登校の親の会などで情報交換をすることで、実際に補助金を利用している保護者の体験談や申請のコツを聞くこともできます。一人で抱え込まず、周囲のサポートも活用しながら、お子さんに合った学びの場を見つけていきましょう。

不登校生徒の保護者が選ぶ
総合満足度が高いフリースクール

総合満足度
4.7
マンツーマンで手厚く
高校進学率も◎

トライ式中等部
総合満足度
4.5
勉強/ゲーム/アニメ
が学べて通いやすい

バンタンゲームアカデミー中等部
総合満足度
4.4
ICT+プログラミング
オンライン授業に強い

第一学院中等部

*日本全国どこでもオンラインで学べて、出席認定も受けやすいスクールのみ掲載しています

「不登校になってもフリースクールという選択肢がある」と知っておくだけでも親の精神負担は軽くなります。いざ不登校になるとどうすればいいかわからなくなる方も多いので、情報収集だけは早めにしておきましょう。

最初に検討したいフリースクール

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そんな方は、まずは気になるフリースクールの資料請求をしてみましょう。

資料請求でわかること

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・専攻コースの詳細
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・入学までの流れ

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記事監修

阪口 裕樹のアバター 阪口 裕樹 編集長

自身の発達障害の経験から「生徒一人ひとりに合った学校選びをサポートしたい」という想いで2013年からサイト運営を開始。卒業生への直接取材と、公式サイトや資料に基づいた徹底的な情報検証を続け、現在は年間110万人が訪れるサイトになりました。このフリースクール選びのサイトでは読者が本当に知りたい情報を、分かりやすく誠実にお届けすることをお約束します。

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